Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Frem2Q6NVD0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms