Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Carmil1Q6EDY6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms