Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CltcQ68FD5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CltcQ68FD5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CltcQ68FD5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms