Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms