Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpd52Q62393 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpd52Q62393 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms