Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtmQ62388 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AtmQ62388 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AtmQ62388 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AtmQ62388 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AtmQ62388 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AtmQ62388 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AtmQ62388 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AtmQ62388 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AtmQ62388 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AtmQ62388 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtmQ62388 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AtmQ62388 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms