Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms