Protein–RNA interactions for Protein: Q62261

Sptbn1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn1Q62261 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn1Q62261 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn1Q62261 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn1Q62261 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn1Q62261 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sptbn1Q62261 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn1Q62261 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms