Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vsx2Q61412 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsx2Q61412 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms