Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Meis1Q60954 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms