Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms