Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Atf3Q60765 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms