Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xrcc1Q60596 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xrcc1Q60596 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms