Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sco1Q5SUC9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sco1Q5SUC9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms