Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1810065E05RikQ5NC41 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms