Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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