Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccnl1Q52KE7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccnl1Q52KE7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccnl1Q52KE7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms