Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms