Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3V0E1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3V0E1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3V0E1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3V0E1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3V0E1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3V0E1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3V0E1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q3V0E1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3V0E1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3V0E1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3V0E1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3V0E1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3V0E1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3V0E1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3V0E1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3V0E1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3V0E1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3V0E1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3V0E1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3V0E1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3V0E1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3V0E1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3V0E1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3V0E1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3V0E1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3V0E1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3V0E1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3V0E1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3V0E1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3V0E1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3V0E1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms