Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fchsd2Q3USJ8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fchsd2Q3USJ8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms