Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms