Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbm20Q3UQS8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbm20Q3UQS8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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