Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Washc4Q3UMB9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Washc4Q3UMB9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms