Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrxosQ3UL53 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms