Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zswim8Q3UHH1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms