Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnrc6cQ3UHC0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnrc6cQ3UHC0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms