Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms