Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Smarca4Q3TKT4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Smarca4Q3TKT4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms