Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms