Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Trpm1Q2TV84 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms