Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vax1Q2NKI2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms