Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd3Q14AI6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms