Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cdk18Q04899 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk18Q04899 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms