Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms