Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tff2Q03404 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms