Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms