Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna1sQ02789 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms