Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlh1Q02576 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms