Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mc1rQ01727 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms