Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbp1Q01514 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms