Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lama4P97927 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama4P97927 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama4P97927 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lama4P97927 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lama4P97927 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lama4P97927 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lama4P97927 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lama4P97927 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms