Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig3P97386 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig3P97386 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig3P97386 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig3P97386 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lig3P97386 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms