Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Meis3P97368 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Meis3P97368 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Meis3P97368 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Meis3P97368 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Meis3P97368 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis3P97368 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis3P97368 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis3P97368 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis3P97368 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis3P97368 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis3P97368 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis3P97368 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis3P97368 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Meis3P97368 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Meis3P97368 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Meis3P97368 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Meis3P97368 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Meis3P97368 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Meis3P97368 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Meis3P97368 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Meis3P97368 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms