Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx2P80206 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx2P80206 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx2P80206 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx2P80206 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx2P80206 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx2P80206 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx2P80206 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx2P80206 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms