Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DccP70211 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DccP70211 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DccP70211 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DccP70211 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DccP70211 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DccP70211 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DccP70211 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DccP70211 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DccP70211 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DccP70211 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DccP70211 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DccP70211 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DccP70211 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DccP70211 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DccP70211 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DccP70211 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DccP70211 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DccP70211 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DccP70211 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DccP70211 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DccP70211 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DccP70211 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DccP70211 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DccP70211 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DccP70211 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DccP70211 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DccP70211 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DccP70211 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DccP70211 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DccP70211 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DccP70211 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DccP70211 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DccP70211 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DccP70211 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DccP70211 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DccP70211 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DccP70211 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DccP70211 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DccP70211 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DccP70211 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DccP70211 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DccP70211 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DccP70211 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DccP70211 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DccP70211 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DccP70211 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DccP70211 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DccP70211 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DccP70211 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DccP70211 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DccP70211 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DccP70211 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DccP70211 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DccP70211 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DccP70211 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DccP70211 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DccP70211 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DccP70211 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DccP70211 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DccP70211 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DccP70211 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DccP70211 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DccP70211 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DccP70211 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DccP70211 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DccP70211 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DccP70211 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DccP70211 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DccP70211 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DccP70211 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DccP70211 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DccP70211 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DccP70211 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DccP70211 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DccP70211 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DccP70211 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DccP70211 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DccP70211 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DccP70211 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DccP70211 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DccP70211 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DccP70211 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DccP70211 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DccP70211 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DccP70211 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DccP70211 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DccP70211 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DccP70211 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DccP70211 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DccP70211 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DccP70211 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DccP70211 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DccP70211 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DccP70211 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DccP70211 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DccP70211 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DccP70211 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DccP70211 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DccP70211 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms