Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf5P70191 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf5P70191 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf5P70191 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf5P70191 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf5P70191 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf5P70191 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf5P70191 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Traf5P70191 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf5P70191 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms