Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms