Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx1bP61264 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx1bP61264 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx1bP61264 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx1bP61264 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx1bP61264 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx1bP61264 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx1bP61264 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx1bP61264 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx1bP61264 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx1bP61264 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx1bP61264 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx1bP61264 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx1bP61264 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx1bP61264 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx1bP61264 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx1bP61264 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx1bP61264 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx1bP61264 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx1bP61264 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1bP61264 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms