Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b6P59708 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms