Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps33bP59016 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms